Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PRDM12Q9H4Q4 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PRDM12Q9H4Q4 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms