Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Cryba2-201ENSMUST00000006721 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Nr1h3-203ENSMUST00000111355 1672 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Maged2-202ENSMUST00000112697 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Tbx10-201ENSMUST00000041871 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Dcaf11-202ENSMUST00000117236 2538 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atxn3Q9CVD2 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms