Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 RWDD4-205ENST00000510968 1551 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 DDX59-206ENST00000447706 2900 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CEP44Q9C0F1 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CEP44Q9C0F1 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms