Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 KCNN3-202ENST00000358505 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AC011471.3-201ENST00000623576 402 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 ERP29P1-201ENST00000442902 706 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
SCAPERQ9BY12 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms