Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF148Q8N7C7 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.1 ms