Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L0

CCDC155, Protein KASH5, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC155Q8N6L0 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC155Q8N6L0 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC155Q8N6L0 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC155Q8N6L0 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC155Q8N6L0 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC155Q8N6L0 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC155Q8N6L0 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC155Q8N6L0 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC155Q8N6L0 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC155Q8N6L0 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC155Q8N6L0 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC155Q8N6L0 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC155Q8N6L0 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC155Q8N6L0 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms