Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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C9orf40Q8IXQ3 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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C9orf40Q8IXQ3 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
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C9orf40Q8IXQ3 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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C9orf40Q8IXQ3 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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C9orf40Q8IXQ3 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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C9orf40Q8IXQ3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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C9orf40Q8IXQ3 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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C9orf40Q8IXQ3 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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C9orf40Q8IXQ3 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
C9orf40Q8IXQ3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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