Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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LINC00299Q6ZSB3 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 GUCY1B3-205ENST00000505764 2456 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 HJURP-207ENST00000441687 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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LINC00299Q6ZSB3 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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LINC00299Q6ZSB3 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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LINC00299Q6ZSB3 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 MPZL2-201ENST00000278937 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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LINC00299Q6ZSB3 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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LINC00299Q6ZSB3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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LINC00299Q6ZSB3 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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LINC00299Q6ZSB3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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LINC00299Q6ZSB3 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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LINC00299Q6ZSB3 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 AL031719.1-201ENST00000623365 2587 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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LINC00299Q6ZSB3 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 TRPC7-201ENST00000352189 2241 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LINC00299Q6ZSB3 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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