Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 MIR3907-201ENST00000579424 151 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SCARF1Q14162 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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