Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 MC3R-201ENST00000243911 1084 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 RTN4RL2-203ENST00000533205 637 ntTSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 LINC02018-201ENST00000608169 1268 ntTSL 4 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 AC021016.3-201ENST00000608367 477 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 AL627230.2-201ENST00000613254 655 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 AC137936.2-202ENST00000638124 1146 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 SH3BGR-209ENST00000458295 812 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
FOXC1Q12948 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms