Protein–RNA interactions for Protein: P51787

KCNQ1, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1P51787 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AC074138.1-201ENST00000611182 1303 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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KCNQ1P51787 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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KCNQ1P51787 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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KCNQ1P51787 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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KCNQ1P51787 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
KCNQ1P51787 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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