Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TTPAP49638 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TTPAP49638 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TTPAP49638 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms