Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

Predictions only

Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPFP49454 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPFP49454 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPFP49454 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPFP49454 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPFP49454 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPFP49454 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPFP49454 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPFP49454 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CENPFP49454 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 AL136040.2-201ENST00000618431 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 OST4-201ENST00000429985 559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
CENPFP49454 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPFP49454 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPFP49454 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPFP49454 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPFP49454 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPFP49454 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPFP49454 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPFP49454 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPFP49454 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPFP49454 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPFP49454 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPFP49454 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPFP49454 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPFP49454 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPFP49454 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPFP49454 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPFP49454 AL365275.1-201ENST00000518570 471 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPFP49454 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPFP49454 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPFP49454 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPFP49454 KIR2DS4-201ENST00000339924 1608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPFP49454 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPFP49454 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPFP49454 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPFP49454 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPFP49454 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPFP49454 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPFP49454 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPFP49454 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
CENPFP49454 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPFP49454 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPFP49454 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPFP49454 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPFP49454 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPFP49454 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPFP49454 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPFP49454 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPFP49454 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPFP49454 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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CENPFP49454 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPFP49454 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPFP49454 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPFP49454 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPFP49454 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPFP49454 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPFP49454 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPFP49454 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPFP49454 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPFP49454 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPFP49454 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CENPFP49454 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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