Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NEBLO76041 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEBLO76041 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEBLO76041 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEBLO76041 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEBLO76041 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NEBLO76041 NFKB2-204ENST00000428099 3416 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 DEPTOR-201ENST00000286234 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEBLO76041 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 COL1A2-201ENST00000297268 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEBLO76041 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms