Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
HOXA3O43365 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms