Protein–RNA interactions for Protein: O15315

RAD51B, DNA repair protein RAD51 homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51BO15315 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
RAD51BO15315 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms