Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SOBPA7XYQ1 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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