Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
VWA8A3KMH1 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 ABHD4-201ENST00000216327 716 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 LINC02076-201ENST00000577684 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 RPL3-202ENST00000401609 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
VWA8A3KMH1 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms