Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YWF9

TRBV2, T-cell receptor beta variable 2 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV2A0A0J9YWF9 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
TRBV2A0A0J9YWF9 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms