Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TTF2Q9UNY4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms