Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 MGC16275-201ENST00000499670 2501 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 B3GNT5-202ENST00000460419 3368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PCGF6Q9BYE7 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PCGF6Q9BYE7 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms