Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 CDHR5-203ENST00000397542 3489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 WASHC5-202ENST00000517845 3667 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RHOXF2Q9BQY4 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 FOXM1-203ENST00000361953 3370 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RHOXF2Q9BQY4 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms