Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
LTV1Q96GA3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms