Protein–RNA interactions for Protein: Q92925

SMARCD2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD2Q92925 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SMARCD2Q92925 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms