Protein–RNA interactions for Protein: Q68D20

PMS2CL, Protein PMS2CL, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2CLQ68D20 CCDC51-201ENST00000395694 1560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 CNN1-201ENST00000252456 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 HSD17B6-207ENST00000555805 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 SMIM6-201ENST00000556126 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 RASSF6-202ENST00000335049 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PMS2CLQ68D20 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2CLQ68D20 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2CLQ68D20 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2CLQ68D20 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2CLQ68D20 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PMS2CLQ68D20 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms