Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 ST13P19-201ENST00000442505 1124 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AC063977.3-201ENST00000597569 547 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GREB1Q4ZG55 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms