Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 YLPM1-207ENST00000552421 4899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 LPCAT2-201ENST00000262134 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 CACNA1G-208ENST00000442258 7226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 SOGA3-207ENST00000481848 11464 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 SULF1-202ENST00000402687 4891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 DPP10-201ENST00000310323 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
TRIM16LQ309B1 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 ZNF721-205ENST00000511833 2966 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
TRIM16LQ309B1 ZNF419-202ENST00000347466 3654 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms