Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
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CCDC96Q2M329 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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CCDC96Q2M329 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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CCDC96Q2M329 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
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CCDC96Q2M329 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CCDC96Q2M329 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
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