Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CA9Q16790 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CA9Q16790 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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CA9Q16790 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CA9Q16790 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CA9Q16790 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CA9Q16790 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CA9Q16790 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CA9Q16790 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CA9Q16790 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CA9Q16790 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CA9Q16790 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CA9Q16790 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CA9Q16790 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CA9Q16790 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CA9Q16790 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CA9Q16790 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CA9Q16790 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CA9Q16790 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CA9Q16790 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CA9Q16790 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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