Protein–RNA interactions for Protein: Q14213

EBI3, Interleukin-27 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBI3Q14213 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
EBI3Q14213 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms