Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ZSCAN32-215ENST00000618425 2788 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AC093668.2-201ENST00000481893 3569 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 AC105052.1-201ENST00000519541 3569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CUL3Q13618 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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