Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 ARHGEF26-202ENST00000465093 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 FOSB-212ENST00000592811 3089 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
FOXD4Q12950 ICE1-201ENST00000296564 7927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 PIM1-201ENST00000373509 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 LYN-204ENST00000520220 5808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 AC087164.2-201ENST00000624514 3130 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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FOXD4Q12950 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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FOXD4Q12950 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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FOXD4Q12950 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FOXD4Q12950 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FOXD4Q12950 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FOXD4Q12950 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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FOXD4Q12950 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
FOXD4Q12950 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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