Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DSG1Q02413 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms