Protein–RNA interactions for Protein: P78395

PRAME, Melanoma antigen preferentially expressed in tumors, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEP78395 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
PRAMEP78395 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms