Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGAEP38570 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms