Protein–RNA interactions for Protein: O75449

KATNA1, Katanin p60 ATPase-containing subunit A1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNA1O75449 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNA1O75449 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNA1O75449 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNA1O75449 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
KATNA1O75449 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KATNA1O75449 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KATNA1O75449 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KATNA1O75449 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KATNA1O75449 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KATNA1O75449 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KATNA1O75449 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KATNA1O75449 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
KATNA1O75449 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KATNA1O75449 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KATNA1O75449 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KATNA1O75449 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KATNA1O75449 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
KATNA1O75449 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
KATNA1O75449 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
KATNA1O75449 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.8 ms