Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEDD8-MDP1E9PL57 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms