Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
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C4orf47A7E2U8 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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C4orf47A7E2U8 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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C4orf47A7E2U8 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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C4orf47A7E2U8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
C4orf47A7E2U8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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C4orf47A7E2U8 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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C4orf47A7E2U8 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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C4orf47A7E2U8 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
C4orf47A7E2U8 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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