Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMEM30AQ9NV96 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM30AQ9NV96 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms