Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 DNAJA1-201ENST00000330899 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CLSPNQ9HAW4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLSPNQ9HAW4 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms