Protein–RNA interactions for Protein: Q93088

BHMT, Betaine--homocysteine S-methyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHMTQ93088 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
BHMTQ93088 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 PID1-202ENST00000392054 2745 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
BHMTQ93088 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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