Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RUFY3Q7L099 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms