Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 AC010973.2-201ENST00000485974 1230 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GDF6Q6KF10 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms