Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Pdzk1ip1-202ENSMUST00000106548 887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Gm42660-201ENSMUST00000197733 947 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 C230062I16Rik-203ENSMUST00000208015 648 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Gm45388-201ENSMUST00000209922 1132 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Kdm5dQ62240 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 AC154354.1-203ENSMUST00000225565 1364 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 1700025C18Rik-201ENSMUST00000109304 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Mrps36-203ENSMUST00000109333 701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gm31520-203ENSMUST00000204874 647 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 CT030166.5-201ENSMUST00000222249 420 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gpr143-201ENSMUST00000026383 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Tnnt3-211ENSMUST00000105949 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gm20493-201ENSMUST00000173706 213 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gm27440-201ENSMUST00000184785 107 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gm42751-201ENSMUST00000198065 559 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gm45040-201ENSMUST00000207742 578 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Olfr71-201ENSMUST00000055401 939 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Eef1akmt4-202ENSMUST00000119224 1464 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gm31138-201ENSMUST00000212296 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Mybl1-202ENSMUST00000115468 2493 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 4930546C10Rik-201ENSMUST00000025428 363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Lsm8-201ENSMUST00000056398 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 AC153524.2-201ENSMUST00000218351 1375 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Il33-201ENSMUST00000025724 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gm27826-201ENSMUST00000175282 255 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gm21964-201ENSMUST00000178785 936 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gm31557-202ENSMUST00000213995 722 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 AC140409.3-201ENSMUST00000215601 358 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Klf3-202ENSMUST00000166409 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Kdm5dQ62240 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
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