Protein–RNA interactions for Protein: Q2VWA4

SKOR2, SKI family transcriptional corepressor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR2Q2VWA4 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 SYCP2L-201ENST00000283141 3130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 FBXL12-201ENST00000247977 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 B4GALT6-201ENST00000237019 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 DUSP28-202ENST00000405954 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
SKOR2Q2VWA4 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms