Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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RTL8BQ17RB0 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
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RTL8BQ17RB0 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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RTL8BQ17RB0 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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RTL8BQ17RB0 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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RTL8BQ17RB0 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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RTL8BQ17RB0 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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RTL8BQ17RB0 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
RTL8BQ17RB0 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
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