Protein–RNA interactions for Protein: Q16527

CSRP2, Cysteine and glycine-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP2Q16527 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSRP2Q16527 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSRP2Q16527 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CSRP2Q16527 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CSRP2Q16527 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
CSRP2Q16527 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSRP2Q16527 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSRP2Q16527 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSRP2Q16527 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSRP2Q16527 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSRP2Q16527 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSRP2Q16527 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSRP2Q16527 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSRP2Q16527 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CSRP2Q16527 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 AL118508.1-202ENST00000411595 709 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 AL365295.1-203ENST00000435322 566 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CSRP2Q16527 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms