Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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GBX1Q14549 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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GBX1Q14549 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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GBX1Q14549 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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GBX1Q14549 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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GBX1Q14549 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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GBX1Q14549 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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GBX1Q14549 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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GBX1Q14549 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GBX1Q14549 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GBX1Q14549 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GBX1Q14549 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GBX1Q14549 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
GBX1Q14549 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GBX1Q14549 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GBX1Q14549 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
GBX1Q14549 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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