Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NEUROD1Q13562 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NEUROD1Q13562 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
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