Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 TRMT1-217ENST00000592062 2579 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XRCC4Q13426 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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